O Sindicato Nacional dos Auditores Fiscais Federais Agropecuários (ANFFA Sindical) realiza um movimento defendendo a reestruturação do serviço de fiscalização e contra a intenção de que os próprios frigoríficos ou abatedouros contratem profissionais para realizar a fiscalização. Segundo a presidente da entidade Consuelo Garrastazu Paixão Cortes, atualmente a equipe de fiscalização conta somente com 40% da força de trabalho para executar as funções.

De acordo com Consuelo, a precarização do trabalho dos fiscais e a indicação política para cargos técnicos tem como resultado problemas a exemplo daqueles apontados na Operação Carne Fraca. Em entrevista ao apresentador Ricardo Capelli, no programa Revista Rural da Rádio São Francisco, a presidente relata um exemplo da resistência que as medidas encontram no âmbito político nacional.