Duas doenças provocadas por fungos foram constatadas nos pomares de maçã de Vacaria nos últimos dias. O fungo chamado de glomerella provoca as manchas nas folhas e a podridão nas frutas da variedade Gala. A colheita está concluída mas os impactos dessa doença estão sendo verificados. O fungo está age também na variedade pink lady que está sendo colhida ainda. A pesquisadora Rosa Valdebenito Sanhueza destaca que o fungo glomerella surgiu nos pomares por causa de falhas nos sistemas de proteção.

Outra doença vem sendo detectada também na variedade fuji. Trata se da podridão carpelar e que no momento não possui forma de controle.